飞锤式去毛刺机的缺点包括：

1. 噪音大：飞锤式去毛刺机在工作时会产生较大的噪音，有可能对工作人员的听力造成影响并影响工作环境。

2. 能耗高：由于飞锤式去毛刺机需要通过高速振动来清除毛刺，因此消耗的能量较大，导致能源消耗较高。

3. 操作复杂：飞锤式去毛刺机需要操作人员熟练掌握使用技巧，并根据不同工件的形状和材质进行调整，操作相对较复杂。

4. 对工件有一定损伤风险：由于高速振动力的作用，飞锤式去毛刺机有可能对工件表面造成一定的划伤或磨损，需要进行适当的控制和保护。

5. 适用范围有限：飞锤式去毛刺机更适用于较大的工件表面去毛刺，对于较小细密的毛刺去除效果较差，适用范围有一定限制。

需要注意的是，不同品牌和型号的飞锤式去毛刺机可能存在差异，所以具体的缺点还需参考具体设备的说明和用户反馈。